Об освоении методики секвенирования специалистом учреждения

С 19 по 23 марта 2018 года ведущий микробиолог сектора молекулярных и серологических видов испытаний Кочуров А.С. принял участите учебно-практическом семинаре на базе ФГБУ «ВНИИКР». Тема семинара: «Применение метода секвенирования для диагностики карантинных и вредных организмов».

В соответствие с темой семинара были поставлены задачи о возможности применения метода секвенирования для диагностики карантинных и вредных организмов на базе лаборатории испытательного центра ФГБУ «Ростовский референтный центр Россельхознадзора». В целях реализации поставленных задач в сентябре 2017 года в рамках государственной программы лаборатория испытательного центра была оснащена генетическим анализатором (секвенатором) Applied Biosystems 3500. В этот же период проведены пуско-наладочные работы, сформирована заявка на приобретение расходных материалов и реагентов.

Прибор предназначен для проведения генетического анализа методом секвенирования. Секвенирование (от лат. sequentum – последовательность) биополимеров (в частности, нуклеиновых кислот) – это определение их нуклеотидной последовательности. В результате секвенирования получают формальное описание первичной структуры линейной макромолекулы в виде последовательности мономеров в текстовом виде.

Секвенировние ДНК является самой передовой модификацией молекулярного метода, позволяющей самостоятельно расшифровывать нуклеотидную последовательность определённого участка генома. Секвенирование позволяет с высокой степенью достоверности идентифицировать карантинные объекты на любой стадии их развития и при полном отсутствии морфологических признаков.

Этап секвенирования в генетическом анализе позволяет разработать и другие молекулярно-генетические методы для малоизученных объектов, нуклеотидные последовательности которых отсутствуют в генетическом банке. К таким объектам можно отнести карантинные виды насекомых, сорных растений. Фрагментный анализ позволяет существенно модернизировать известные методы идентификации грибов и бактерий, который также невозможно провести без секвенатора.

Участники семинара были ознакомлены с программой проведения обучения. Обсуждались вопросы по диагностике карантинных и вредных объектов с использованием передовых методов на основе молекулярно-генетического анализа. Проводился анализ проблемных вопросов о сложности работы с карантинными объектами, отсутствующими на территории Российской Федерации, но имеющими риск ввоза в нашу страну. Теоретические занятия чередовались с практической работой. В ходе практических занятий отработаны все этапы генетического анализа с использованием секвенатора Applied Biosystems 3500. В конце семинара специалист получил сертификат о повышении квалификации.

Самостоятельное выполнение работ по секвенированию на базе нашей лаборатории является важным этапом развития направления диагностики карантинных и вредных объектов в целом.